Sinopse: Um dia, o sol vermelho brilhante parou de brilhar, causando o "Fenômeno de Quebra" - a destruição da cidade de Arata Kasuga e o desaparecimento das pessoas que a habitavam. Tudo, porém, ainda não está perdido; Ao utilizar o grimório mágico dado a ele por seu amigo de infância e primo Hijiri Kasuga, o mundo de Arata é reconstruído artificialmente. A fim de investigar o fenômeno, Lilith Asami aparece diante de Arata, cujo mundo artificial de repente se desintegra. Ele tem duas opções: entregar o livro ou morrer. No entanto, Arata escolhe a terceira opção - matricular-se na escola de magia ultra-secreta Royal Biblia Academy, onde seis outros usuários mágicos o aguardam. Juntamente com Lilith, esses seis formam a Trinity Seven, a elite da escola que reforça seu próprio poder e habilidade. Com a ambição de salvar Hijiri e a ajuda de seus novos amigos, Arata não pára por nada para impedir a destruição de sua amada cidade natal e trazer seu melhor amigo de volta.